无人机使用的弹药并非单一固定，而是一个可让玩家根据战况自由选择的模块化系统，其核心优势在于可以自由搭载三种不同伤害属性的弹药模组，分别是磁轨无人机模块（动能伤害）、激光无人机模块（热能伤害）以及粒子无人机模块（电磁伤害）。
选择何种弹药的核心依据是敌人的防御抗性，磁轨无人机模块擅长穿透厚重的装甲，对付装甲防御强的目标有奇效。激光无人机模块则提供了更为均衡和稳定的输出，对护盾和装甲都能造成可观的伤害，适合在敌人类型未知或混杂时作为通用选择。粒子无人机模块的特点是短射程下的高伤害和高跟踪能力，尤其在高速移动的对抗中，能有效抵消因速度带来的命中惩罚，表现非常出色。
无人机弹药需要你在出击前于仓库中提前装配好，战斗中无法临时更换，所以养成检查弹药库存的习惯至关重要。弹药款式分为单联和多联，单联适合对单一高价值目标进行精确打击，而多联则能快速清扫成群的小型敌人。所有被发射的无人机都会拥有独立的能量值，出舱后会持续消耗，能量耗尽便会自动返航，并且会根据返航的无人机数量返还部分弹药，这一设计降低了长线作战的补给压力。
无人机作为武器平台拥有独特的战术特性，它在发射离舱后会自动攻击你当前锁定的目标，并在摧毁目标后自动寻找下一个或自卫反击，实现了发射后不管。更为关键的是，无人机在发射后完全免疫任何武器干扰效果，并且在出舱前从母舰获得的武器增益会伴随其整个战斗过程，直到返航或被击毁，这保证了其在复杂电子战环境下的输出稳定性。
进行常规任务时，动能弹药泛用性较强。若已知敌人护盾脆弱，则可换上热能弹药。面对高速舰船或需要干扰对方系统时，电磁弹药是更好的选择。尤其是在探索虫洞等面对未知敌人的场景时，随身携带多种属性的弹药以备灵活切换尤为重要。需注意虽然所有舰船都能装配无人机，但只有星际合众国和斯瓦罗斯的舰船拥有针对无人机武器的专属加成。
