操作军团的核心是组建多支队伍并统一指挥，这涉及任命都督或太守来管理集结的部队。玩家需先加入同盟，并在攻占郡城后被任命为太守后，才能开启军团功能。成为太守后，玩家可以组建军团，一个军团可以集结五支队伍，这五支队伍可以来自不同玩家，最终交由军团太守进行统一调配指挥。操作时，通过集结指令将五支不同玩家的队伍整合为一个军团，交由太守统一调配，这不仅简化了多部队操作的繁琐性，还能在同盟成员缺席时代为参战。
集结军团，首先需要被任命为太守。太守只能由同盟任命，当同盟攻下了一座郡城之后就可以任命太守了。任命了太守之后玩家就可以集结军团，只需要点击对应的郡城，然后在选项的最下方会出现一个集结选项，点击集结将自己的部队派往郡城。等部队达到郡城之后，太守就可以将其编为军团，每五支部队可以编成一支军团。需注意处于免战状态的部队是无法使用集结指令的，这个免战状态有多种，如新手保护期、闭城状态以及俘虏状态。
在拥有了军团之后，操作上与个人部队有所不同。使用军团向普通领地发起占领指令时，相当于对军团内的所有部队均使用该指令，只要军团中任意一支队伍进入占领状态，则其余的部队均为待命状态。这个过程会扣除军团内所有部队的体力，而且军团内的所有队伍会按照顺序轮流与领地守军发生战斗，直到有任意一支队伍进入占领状态为止。因此建议对双方实力进行恰当的估量，避免白浪费过多的部队体力。处于军团状态的部队不会进行屯田、剿灭贼兵等操作，也不会与玩家自身的木牛流马发生战斗。
当军团处于行军或者作战时，郡城的主界面是不支持玩家点击编辑军团的，正所谓将在外君命有所不受。当军团在外行军作战时，如发现某支队伍不适合此次战役，可以通过军团编辑界面的请离功能将部队请出军团。当军团中有且只有一只队伍时，玩家点击解散军团需要二次确认，以避免误操作。
军团太守功能极大地优化了大规模协同作战的体验。它允许太守通过军团玩法将出战的部队配置成为军团，实现一键操控，省去多支部队分别操作的繁琐步骤。这种集中指挥模式可以解决盟友因时间无法统一而无法支援的问题，实现更精准的配合和打击。军团太守还可以集结器械部队，通过护卫指令将器械运送至前线，例如一次最多能集结50支器械部队绑定军团，并将其运送到营帐、要塞或可调动的NPC城池。
